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北京天諾基業(yè)科技有限公司
閱讀:124發(fā)布時(shí)間:2022-10-19
數(shù)據(jù)集中的9個(gè)列表
1、mixtures
2、tracer_names
3、source_names
4、source_means
5、source_sds
6、correction_means
7、correction_sds
8、concentration_means
9、groups
研究對(duì)象是加拿大東部北極地區(qū)的一種淺腹布蘭特鵝(Branta bernicla hrota),在西歐過(guò)冬。此鵝非彼鵝,會(huì)真飛。

維度為[251x2]的double類型數(shù)組
251行表示數(shù)組中包含251條對(duì)Brent Geese血樣的同位素測(cè)量數(shù)據(jù)。
2列分別表示d13C和d15N的同位素比率,后綴Pl指plasma即血漿。
1#數(shù)組太長(zhǎng),中間部分省略
2> geese_data[["mixtures"]]
3 d13C_Pl d15N_Pl
4 [1,] -11.36 10.22
5 [2,] -11.88 10.37
6 [3,] -10.60 10.44
7 ... ...
8 ... ...
9 ... ...
10[250,] -27.35 7.54
11[251,] -29.14 8.80
穩(wěn)定同位素的名稱,維度為1x2的字符串?dāng)?shù)組
分別代表,鵝血樣品中要分析的兩種穩(wěn)定同位素
1> geese_data[["tracer_names"]]
2[1] "d13C" "d15N"
Brent Geese的食物來(lái)源名稱,維度為1X4的字符串?dāng)?shù)組
原文中對(duì)這幾種食物的描述:
1> geese_data[["source_names"]]
2[1] "Zostera" "Grass" "U.lactuca" "Enteromorpha"
數(shù)據(jù)為源中同位素比率均值,維度為4X2的double型數(shù)組
4行,分別表示4中食物來(lái)源
2列,分別表示2中同位素比率
1> geese_data[["source_means"]]
2 [,1] [,2]
3[1,] -11.17 6.49
4[2,] -30.88 4.43
5[3,] -11.17 11.19
6[4,] -14.06 9.82
數(shù)據(jù)為源中同位素比率標(biāo)準(zhǔn)差,維度為4X2的double型數(shù)據(jù)
行代表4種食物來(lái)源;
列代表2種同位素類型;
1> geese_data[["source_sds"]]
2 [,1] [,2]
3[1,] 1.21 1.46
4[2,] 0.64 2.27
5[3,] 1.96 1.11
6[4,] 1.17 0.83
4種食物來(lái)源,2種同位素的營(yíng)養(yǎng)分餾均值
通過(guò)上下文看,此處營(yíng)養(yǎng)分餾指同位素富集系數(shù)corrections/trophic enrichment factors (TEFs or TDFs),即 Δ A − B = δ A − δ B \Delta_{A-B}=\delta_A-\delta_B ΔA−B?=δA?−δB?,兩種物質(zhì)間是簡(jiǎn)單的相加關(guān)系。
文中關(guān)于修正的描述
在分析中,我們使用了平均δ15N和δ13N值對(duì)不同月份采集的布蘭特鵝血漿和血細(xì)胞進(jìn)行分析。
在輸入到模型之前,首先根據(jù)營(yíng)養(yǎng)分餾(δ15N為3.2,δ13C為1.45)對(duì)測(cè)量值進(jìn)行調(diào)整。分餾值來(lái)自文獻(xiàn)確定的(Bearhop等,1999;Hobson & Bairlein 2003;Evans Ogden, Hobson & Lank 2004)基于圈養(yǎng)鳥類的研究。
1> geese_data[["correction_means"]]
2 [,1] [,2]
3[1,] 1.63 3.54
4[2,] 1.63 3.54
5[3,] 1.63 3.54
6[4,] 1.63 3.54
4種食物來(lái)源,2種同位素的營(yíng)養(yǎng)分餾標(biāo)準(zhǔn)差
1> geese_data[["correction_sds"]]
2 [,1] [,2]
3[1,] 0.63 0.74
4[2,] 0.63 0.74
5[3,] 0.63 0.74
6[4,] 0.63 0.74
4種食物來(lái)源中,2種同位素的濃度依賴均值
當(dāng)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行同位素比率測(cè)定時(shí),同時(shí)也可以測(cè)定元素的濃度。
在一個(gè)典型的混合模型應(yīng)用中,食物來(lái)源和消費(fèi)者組織采用了13C和15N值,有一個(gè)隱含的假設(shè)是,每個(gè)來(lái)源對(duì)消費(fèi)者貢獻(xiàn)的C的比例與它貢獻(xiàn)的N的比例相同。但是,如果C和N濃度差異很大,以致源的C:N比例非常不同,那么這可能是一個(gè)站不住腳的假設(shè)。此時(shí),就需要考慮食物來(lái)源中元素濃度的巨大差異。
由于同位素混合模型評(píng)估的是消費(fèi)者吸收的食物來(lái)源的比例,而不僅僅是消費(fèi)者攝入的食物,因此攝入食物中的元素濃度可能不是最合適的衡量標(biāo)準(zhǔn)。相反,大分子成分(例如,蛋白質(zhì)、脂類、碳水化合物的%)、這些大分子成分的消化率以及C和N濃度將決定從每種食物源吸收的C和N的數(shù)量;Koch和Phillips(2002)展示了這些計(jì)算是如何進(jìn)行的。
4種食物來(lái)源種的C和N的含量測(cè)定:
1> geese_data[["concentration_means"]]
2 [,1] [,2]
3[1,] 0.36 0.03
4[2,] 0.40 0.04
5[3,] 0.21 0.02
6[4,] 0.18 0.01
251個(gè)字符串的列表,分別對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)集中的8個(gè)采樣時(shí)期。和原文數(shù)據(jù)有些出入,可能有些采樣數(shù)據(jù)并未使用。
原文對(duì)采樣時(shí)期的描述

列表很長(zhǎng),中間省略
1> geese_data[["groups"]]
2 [1] "Period 1" "Period 1" "Period 1" "Period 1" "Period 1" "Period 1" "Period 1"
3 [8] "Period 1" "Period 1" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2"
4 [15] "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2"
5 [22] "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2" "Period 2"
6 ... ... ...
7[232] "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8"
8[239] "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8"
9[246] "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8" "Period 8"
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